Decision curve anaysis (决策曲线分析)

决策曲线概述

决策曲线分析最近常用于评价临床决策的好坏, 比如建立一个模型后, 我们需要评价这个模型到底会不会被用于临床决策支持, 这时可以用这个决策分析曲线去评价.

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Nomograph 图制作 (一) - 用 rms 绘制 nomogram

Nomogram 概述

Nomogram,中文常称为诺莫图或者列线图,简单的说是将 Logistic 回归或 Cox 回归的结果进行可视化呈现。它根据所有自变量回归系数的大小来制定评分标准,给每个自变量的每种取值水平一个评分,对每个患者,就可计算得到一个总分,再通过得分与结局发生概率之间的转换函数来计算每个患者的结局时间发生的概率。

R 中用于画 Nomogram 包有 rms 中的 nomogram 函数、 hdnomhdnom 软件包,这篇博客 Nomogram 系列博客的第一篇,主要讲述用 rms 包绘制 Nomograph 的过程。

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科研工作中的生存分析

引子

生存分析是在科研中占有重要位置, 它是分析随时间变化的因素和生存率之间关系的一门学科, 这篇博客主要总结科研工作中的生存分析, 并用 python1 和 R2 代码实现, 彻底理清科研文章中的生存分析3, 4 .

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博客迁移杂记-从 Hexo 到 Nikola

迁移原因

16 年年初,开始搭建自己的个人博客,一不小心入了 spacemacs 的坑,一直用 Org-mode 写作、记笔记等,因此博客必须支持 Org-mode ,最开始的解决方案是 Hexo,用 hexo-renderer-org 将 Org-mde 格式转化,使用 Next 主题,确实比较好看,当时配置博客站点花了很长时间,在使用过程中,总是会有 hexo 插件更新问题,导致博客不能发布等,因此,最近一个月寻找 hexo 的替代者。

Nikola 是用 Python 写的,恰好以后要学 Python,同时 Nikola 通过 Org-mode 插件支持 Org-mode,于是选择 Nikola 作为博客框架,目前一切还好,就是主题比较难看。博客迁移过程用,参考1, 2, 3, 4

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Archlinux Shadowsocks Configuration [Archlinux Shadowsocks 配置]

高等代数- n 维向量空间 n 维向量空间 \(k^n\)

高等代数-行列式

n 元排列

n 个不同正整数的一个全排列称为 n 元排列.

在 n 元排列 \(a_1, a_2, ⋯, a_n\) 中, 任取一对数 \(a_i,a_j(i < j)\), 如果 \(a_i < a_j\), 那么这一对数构成一个 顺序, 否则, 这对数构成一个 逆序. 一个 n 元排列中逆序的总数称为 逆序数, 记作 \(τ(a_1a_2⋯a_n)\).

逆序数为奇数的排列称为 奇排列, 逆序数为偶数的排列称为 偶排列. 将一个排列中的两个数字互换, 其余数字位置不变的变换称为一个 对换.

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概率论与数理统计-随机变量及其概率分布

一维随机变量

随机变量的概念

随机变量的定义:“其值随机会而定”的变量,是试验结果的函数

随机变量的反面为确定性变量,其取值遵循某种严格的规律的变量;

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概率论与数理统计-随机变量的数字特征

数学期望(均值)与中位数

数学期望的定义

\begin{de}[离散型随机变量数学期望]
\end{de}

设离散型随机变量 X 只取有限个可能值 \(a_1, \dots , a_n\) , 其概率分布 \(P(X = a_i) = p_i \, (i = 1, \dots ,m)\) ,则 X 的数学期望记作 \(E(X) or EX\) 定义为 \[E(X) = a_1p_1 + \dots + a_np_n\] ,若 n 取无限个值,若下式收敛,则称其为 X 的数学期望,数学期望也常称为平均,这里平均是加权平均

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概率论与数理统计-事件的概率

概述

概率论与数理统计的学习部分用以下书籍

  • 陈希儒, (2009). 概率论与数理统计. : 中国科技大学出版社.
  • 陈希儒, 倪. (2009). 数理统计学教程. : 中国科技大学出版社.
  • 高惠璇, (2005). 应用多元统计分析. : 北京大学出版社.

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A simple introduction of lengyueyang's spacemacs configration[个人 spacemacs 配置简介]

Table of Contents

Introduction: Emacs Configuration in an Org File

I used spacemacs recently, org-mode is my favourite package of emacs, I use org-mode to GTD, write slide and documents, so I want to use org-mode to manager may own configuration of emacs beyond spacemacs.

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Use Mu4e to manage email [用 mu4e 管理邮件]

Statistics in research article-Univariate analysis [科研文章中的统计-单因素分析]

写作原因

  • 最近学习 R 语言,这篇博客是学习 R 语言一个简单成果展示,这是第一部分,单因素分析
  • 科研论文中的统计方法很重要,关系到结果的可信度,然而中国发表的很多文章,统计过关的不多
  • 本文以 R 语言为切入点,以我自己文章中的数据为原型,简单阐述单因素分析的方法原理及过程
  • 有关 R 语言介绍及安装方法,请移步 R 语言官方网1

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Blog with org-mode and github with Hexo [用 Org-mdoe、Hexo 和 github 搭建博客]

写在前面

  • 长久以来,一直想建立自己的博客,今年开始学习 Emacs,偶遇几位大神用 Hexo 建立博客,于是也动手搭建自己的博客,记录学习过程,记录向数据科学转型学习点滴
  • 本文简述用 Org-mode 写博客,通过 Hexo 搭建博客的过程,我的博客见一家之言

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Use org-mode to make slide [用 org-mode 做幻灯]

缘由:

  • 之前做幻灯一直用 powerpoint,受限于各种格式调整,之后接触到了 latex,开始用 beamer 做幻灯
  • 最近迷恋上了 Reproducible Research,用 org-mode 进行时间管理、写 blog,恰巧最近需要做幻灯,本文记录用 org-mode 进行写做幻灯的过程以及注意事项,本文示例见org-beamer

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Use org-mode to GTD [用 org-mode 做时间管理]

写在前面

  • 最近准备学习 R 和 Python 语言,比较了很多编辑器,最终选择了 Emacs,看到知乎上很多大神推荐 Spacemacs,准备用 Spacemacs 编写程序, 同时建立博客,记录学习过程。
  • 首先接触了 Org-mode,用 org-mode 做时间管理,本文简述我用 org-mode 做时间管理的流程以及配置。
  • 在用 org-mode 之前,应该有一些 Spacemacs 及 Org-mode 的使用经验(参见pacemacs KeybindingOrg Mode Manual)。

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